Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8BQ9ULN7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNMA8BQ9ULN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8BQ9ULN7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8BQ9ULN7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8BQ9ULN7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms