Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms