Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms