Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZNF608Q9ULD9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
ZNF608Q9ULD9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF608Q9ULD9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms