Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
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NRXN1Q9ULB1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NRXN1Q9ULB1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NRXN1Q9ULB1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
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