Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARDHQ9UL12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms