Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU6

TRHDE, Thyrotropin-releasing hormone-degrading ectoenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHDEQ9UKU6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRHDEQ9UKU6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHDEQ9UKU6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms