Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms