Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL4Q9UJQ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1241.6 ms