Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
MLH3Q9UHC1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MLH3Q9UHC1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms