Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SS18L2Q9UHA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18L2Q9UHA2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms