Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC4Q9UBN4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRPC4Q9UBN4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms