Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms