Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPRR3Q9UBC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPRR3Q9UBC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPRR3Q9UBC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPRR3Q9UBC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms