Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO1AQ9UBC5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms