Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP35Q9P2H5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
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