Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSKIPQ9P0R6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms