Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N5

TMEM216, Transmembrane protein 216, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM216Q9P0N5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM216Q9P0N5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM216Q9P0N5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms