Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COA4Q9NYJ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms