Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MTMR4Q9NYA4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTMR4Q9NYA4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR4Q9NYA4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms