Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP4R2Q9NY27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP4R2Q9NY27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms