Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD4Q9NXE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms