Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf42Q9NWW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C2orf42Q9NWW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms