Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A7Q9NVC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A7Q9NVC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms