Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM140Q9NV12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms