Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP2Q9NUQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFSP2Q9NUQ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms