Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms