Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC13Q9NSE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC13Q9NSE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC13Q9NSE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms