Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF275Q9NSD4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF275Q9NSD4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms