Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms