Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC1Q9NRX5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms