Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHPT1Q9NRX4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms