Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TULP4Q9NRJ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TULP4Q9NRJ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms