Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD2Q9NRG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms