Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
XPNPEP3Q9NQH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPNPEP3Q9NQH7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms