Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB9BQ9NP90 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms