Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms