Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DNAJC4Q9NNZ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC4Q9NNZ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms