Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD20

ATP13A1, Manganese-transporting ATPase 13A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A1Q9HD20 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A1Q9HD20 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A1Q9HD20 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms