Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM27Q9HBJ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM27Q9HBJ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM27Q9HBJ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM27Q9HBJ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM27Q9HBJ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM27Q9HBJ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM27Q9HBJ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms