Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSER2Q9H7U1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER2Q9H7U1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms