Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCAD1Q9H4L7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCAD1Q9H4L7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms