Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNMDQ9H2S6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNMDQ9H2S6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms