Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms