Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MED28Q9H204 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms