Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP62CLQ9H1M0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms