Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDCBP2Q9H190 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SDCBP2Q9H190 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCBP2Q9H190 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDCBP2Q9H190 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms