Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN2Q9GZV7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN2Q9GZV7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms