Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDGFDQ9GZP0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDGFDQ9GZP0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms