Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM6Q9C030 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM6Q9C030 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms